泉網(wǎng)站公司標(biāo)改1.GIF)
超級(jí)“生命樹(shù)”草圖問(wèn)世
信息來(lái)源：中國(guó)林業(yè)網(wǎng) 發(fā)布日期：2015-09-29 瀏覽次數(shù)：4402次
囊括230萬(wàn)物種 追溯到35億年前
超級(jí)“生命樹(shù)”草圖問(wèn)世
從鴨嘴獸到馬勃菌，首張描繪包含230萬(wàn)種已命名的動(dòng)物、植物、真菌和微生物的“生命樹(shù)”草圖問(wèn)世了。
生物會(huì)隨時(shí)間推移衍生出不同分支。在11個(gè)機(jī)構(gòu)的通力合作下，生命樹(shù)描繪出生物間的關(guān)系，一直追溯到35億年前地球上生命起源之時(shí)。
多年來(lái)，人們已繪制出數(shù)以萬(wàn)計(jì)的選定分支的較小的生命樹(shù)———有些包含多達(dá)10萬(wàn)個(gè)物種。不過(guò)，將這些成果融合成囊括所有地球生命的單棵樹(shù)在人類(lèi)歷史上尚屬首次。這樣做的最終結(jié)果是形成一個(gè)所有人均可使用和編輯的免費(fèi)網(wǎng)絡(luò)資源庫(kù)，很像是進(jìn)化樹(shù)的“維基百科”。
主要調(diào)查員、杜克大學(xué)的卡倫克蘭斯頓說(shuō)：“這是人類(lèi)第一次真正嘗試將所有節(jié)點(diǎn)聯(lián)系起來(lái)。你可以將它看作1.0版。”1.0版生命之樹(shù)可在網(wǎng)上瀏覽和下載，網(wǎng)址為https：//tree.opentreeoflife.org。
美國(guó)《國(guó)家科學(xué)院學(xué)報(bào)》月刊9月18日刊登的一篇文章也對(duì)它進(jìn)行了描述。
進(jìn)化樹(shù)并非只是用來(lái)搞清鼴鼠和海牛誰(shuí)與土豚的親緣關(guān)系更近，或是確定黏菌的近親是誰(shuí)。認(rèn)清地球上數(shù)百萬(wàn)物種之間的關(guān)系有助于科學(xué)家研制新藥，提高農(nóng)作物和牲畜產(chǎn)量，追蹤艾滋病、埃博拉和流感等傳染病的起源和傳播過(guò)程。
研究人員并非從零開(kāi)始建起生命樹(shù)的，他們將數(shù)以千計(jì)已發(fā)布在網(wǎng)上的較小“枝干”拼湊起來(lái)，融合成一棵包含所有已命名物種的巨大的“超級(jí)樹(shù)”。
生命樹(shù)的初稿是根據(jù)之前發(fā)布的近500棵小型生命樹(shù)繪制而成的。
要將來(lái)源不同的樹(shù)歸入單棵超級(jí)樹(shù)的枝丫中，最大的挑戰(zhàn)之一便是弄清各物種的名稱(chēng)變化、別名、常見(jiàn)拼寫(xiě)錯(cuò)誤和縮寫(xiě)。
研究人員寫(xiě)道：“盡管這項(xiàng)任務(wù)艱巨龐雜，生命樹(shù)草圖只是我們邁出的第一步。”
在已發(fā)布的生命樹(shù)中，只有一小部分有數(shù)字版本。針對(duì)2000年至2012年100多個(gè)期刊上發(fā)表的7500多項(xiàng)生物種族發(fā)展史研究的調(diào)查顯示，僅有1/6的研究人員將他們的數(shù)據(jù)以數(shù)字、可下載的形式存儲(chǔ)起來(lái)，供其他研究者使用。
絕大部分進(jìn)化樹(shù)以PDF和其他圖像文件形式呈現(xiàn)，無(wú)法融入數(shù)據(jù)庫(kù)或與其他進(jìn)化樹(shù)合并。
克蘭斯頓說(shuō)：“科學(xué)家所掌握的生物關(guān)系知識(shí)和真正能獲得的數(shù)字版本之間存在巨大差距。”
因此，生命樹(shù)某些部分描繪的關(guān)系與專(zhuān)家觀點(diǎn)時(shí)有出入。這是因?yàn)椋幢闶蔷W(wǎng)上最熱門(mén)的原始基因序列檔案———諸多進(jìn)化樹(shù)繪制的基礎(chǔ)，其包含的DNA數(shù)據(jù)也不到地球上數(shù)以千萬(wàn)計(jì)的物種的DNA數(shù)據(jù)的5%。
為填補(bǔ)空白，該團(tuán)隊(duì)還研發(fā)了一款軟件，讓研究人員能登錄并更新、改寫(xiě)這棵生命樹(shù)。
生物會(huì)隨時(shí)間推移衍生出不同分支。在11個(gè)機(jī)構(gòu)的通力合作下，生命樹(shù)描繪出生物間的關(guān)系，一直追溯到35億年前地球上生命起源之時(shí)。
多年來(lái)，人們已繪制出數(shù)以萬(wàn)計(jì)的選定分支的較小的生命樹(shù)———有些包含多達(dá)10萬(wàn)個(gè)物種。不過(guò)，將這些成果融合成囊括所有地球生命的單棵樹(shù)在人類(lèi)歷史上尚屬首次。這樣做的最終結(jié)果是形成一個(gè)所有人均可使用和編輯的免費(fèi)網(wǎng)絡(luò)資源庫(kù)，很像是進(jìn)化樹(shù)的“維基百科”。
主要調(diào)查員、杜克大學(xué)的卡倫克蘭斯頓說(shuō)：“這是人類(lèi)第一次真正嘗試將所有節(jié)點(diǎn)聯(lián)系起來(lái)。你可以將它看作1.0版。”1.0版生命之樹(shù)可在網(wǎng)上瀏覽和下載，網(wǎng)址為https：//tree.opentreeoflife.org。
美國(guó)《國(guó)家科學(xué)院學(xué)報(bào)》月刊9月18日刊登的一篇文章也對(duì)它進(jìn)行了描述。
進(jìn)化樹(shù)并非只是用來(lái)搞清鼴鼠和海牛誰(shuí)與土豚的親緣關(guān)系更近，或是確定黏菌的近親是誰(shuí)。認(rèn)清地球上數(shù)百萬(wàn)物種之間的關(guān)系有助于科學(xué)家研制新藥，提高農(nóng)作物和牲畜產(chǎn)量，追蹤艾滋病、埃博拉和流感等傳染病的起源和傳播過(guò)程。
研究人員并非從零開(kāi)始建起生命樹(shù)的，他們將數(shù)以千計(jì)已發(fā)布在網(wǎng)上的較小“枝干”拼湊起來(lái)，融合成一棵包含所有已命名物種的巨大的“超級(jí)樹(shù)”。
生命樹(shù)的初稿是根據(jù)之前發(fā)布的近500棵小型生命樹(shù)繪制而成的。
要將來(lái)源不同的樹(shù)歸入單棵超級(jí)樹(shù)的枝丫中，最大的挑戰(zhàn)之一便是弄清各物種的名稱(chēng)變化、別名、常見(jiàn)拼寫(xiě)錯(cuò)誤和縮寫(xiě)。
研究人員寫(xiě)道：“盡管這項(xiàng)任務(wù)艱巨龐雜，生命樹(shù)草圖只是我們邁出的第一步。”
在已發(fā)布的生命樹(shù)中，只有一小部分有數(shù)字版本。針對(duì)2000年至2012年100多個(gè)期刊上發(fā)表的7500多項(xiàng)生物種族發(fā)展史研究的調(diào)查顯示，僅有1/6的研究人員將他們的數(shù)據(jù)以數(shù)字、可下載的形式存儲(chǔ)起來(lái)，供其他研究者使用。
絕大部分進(jìn)化樹(shù)以PDF和其他圖像文件形式呈現(xiàn)，無(wú)法融入數(shù)據(jù)庫(kù)或與其他進(jìn)化樹(shù)合并。
克蘭斯頓說(shuō)：“科學(xué)家所掌握的生物關(guān)系知識(shí)和真正能獲得的數(shù)字版本之間存在巨大差距。”
因此，生命樹(shù)某些部分描繪的關(guān)系與專(zhuān)家觀點(diǎn)時(shí)有出入。這是因?yàn)椋幢闶蔷W(wǎng)上最熱門(mén)的原始基因序列檔案———諸多進(jìn)化樹(shù)繪制的基礎(chǔ)，其包含的DNA數(shù)據(jù)也不到地球上數(shù)以千萬(wàn)計(jì)的物種的DNA數(shù)據(jù)的5%。
為填補(bǔ)空白，該團(tuán)隊(duì)還研發(fā)了一款軟件，讓研究人員能登錄并更新、改寫(xiě)這棵生命樹(shù)。
.png){kind=small}
